Programski paketi otvorenog koda kao i paketi s licencama u vlasništvu CNRM-a integrirani su kao dio osnovne programske podrške Superračunala. Predinstalirani temeljni programski paketi dostupni korisnicima navedeni su u nastavku:

Programski paketi otvorenog koda

• ABINIT
• AlphaFold
• AmberTools
• Atomic Simulation Environment
• AutodocVINA
• BLAST
• Blender
• Bowtie 2
• Burrows-Wheeler Aligner
• CalculiX
• CP2K
• deal.II
• Eigen
• FreeCAD
• FreeFEM
• GROMACS
• kallisto
• LAMMPS
• NWChem
• OpenFOAM ESI
• OpenFOAM EXTEND
• OpenFOAM ORG
• ParaView
• PLUMED
• PyTorch
• Quantum ESPRESSO
• ROOT
• rDock/RxDock
• Rosetta
• SAMtools
• Singularity
• STAR
• TensorFlow
• TopHat
• Trans-ABySS
• Weather Research and Forecasting Model

Licencirani programski paketi

• Altair AcuSolve
• Altair nanoFluidX
• Altair OptiStruct
• Altair Radioss
• Altair ultraFluidX
• DIRAC
• GAMESS
• GROMOS
• MATLAB
• MOMAP
• NAMD
• VAPOR
• VMD

 
Instalacija dodatnih paketa
Dodatna se programska podrška može osigurati na zahtjev korisnika. Za instalaciju vlasničkih programskih paketa korisnik mora posjedovati odgovarajuću licencu za rad u superračunalnom okruženju. Općenito, programski paketi moraju biti namjenjeni za Linux te kompatibilni s Red Hat Enterprise Linux 7.

Razvoj programske podrške
Na Sveučilištu u Rijeci djeluju istraživačke skupine koje razvijaju znanstvenu programsku podršku za potrebe vlastitih istraživanja te u okviru projekata razvoja programske podrške, a specijaliziranu za izvođenje na superračunalu. Spomenute grupe djeluju na sastavnicama Sveučilišta:

• Odjel za biotehnologiju, Laboratorij za strukturu i funkciju biomolekula, voditelj doc. dr. sc. Željko Svedružić
• Odjel za fiziku, Laboratorij za astročestičnu fiziku, voditelj doc. dr. sc. Tomislav Terzić
• Tehnički fakultet, Zavod za mehaniku fluida i računarsko inženjerstvo, voditelj izv. prof. dr. sc. Lado Kranjčević